https://github.com/matterport/Mask_RCNN/issues/2510 failed to run cuBLAS routine: CUBLAS_STATUS_EXECUTION_FAILED while training during Epoch 1/1 · Issue #2510 · matterport/Mask_R Error Logs Epoch 1/1 C:\Users\DanielSun\PycharmProjects\FRC-opencv-python\venv\lib\site-packages\skimage\transform\_warps.py:830: FutureWarning: Input image dtype is bool. Interpolation is not defi... github.com 해당 답변을 ..
안그러면 아래와 같은 형태로 export된다. 그리고 rdkit object에는 바로 str변환이 불가능한 것 같다. 다음처럼 .ToBitString()이라는 메서드로 한번 변환한 뒤에 str()으로 감싸서 변환해주자. def bitvect_to_str(bitvect): temp = str(bitvect.ToBitString()) temp = "\t".join(temp) return temp # Apply the function to convert the 'MorganFingerprint' column to a list of 0s and 1s df['morgan_fp_r2'] = df['morgan_fp_r2'].apply(bitvect_to_str) # Now the 'MorganFingerprint'..
한줄 요약 : 이상한 형태로 batchify가 되는 데이터의 타입을 확인해보고 nd.array가 아니라 list라면 nd.array로 변경하자. class ProteinSequenceDataset(Dataset): def __init__(self, df, tokenizer): self.df = df self.tokenizer = tokenizer def __len__(self): return len(self.df) def __getitem__(self, item): p = self.df.iloc[item]['Target Sequence'] s = self.df.iloc[item]['SPS'] d = self.df.iloc[item]['SMILES'] p_v = protein2emb_encoder(p) #..
VS Code에서 터미널 명령어 실행하려 할 때 터미널이 PowerShell로 설정되어 있으면 곤란하다. CMD로 변경해서 사용하자. 1. Ctrl + ,(쉼표) 눌러서 세팅을 들어간다음 'default profile'을 검색하자. 천천히 내려서 Terminal > Ingegrated > Default Profile : Windows 설정을 찾는다. 2. Power Shell로 default 설정이 되어있거나 다른 설정이 되어있을텐데, 이것을 Command Prompt로 변경해준다. 3. 다음 VS code를 한번 재시작하거나 터미널 콘솔창 오른쪽 상단의 휴지통을 한번 눌러주고, 다시 Ctrl + shift + `(숫자1 왼쪽) 입력해서 실행해보면 cmd로 설정된 터미널이 열리는 것을 확인할 수 있다.
torch의 nn module 내부의 loss function을 이용해서 loss를 구할 때에는 반드시 input의 type을 float으로 수정해준다. # 이하 코드는 input의 type이 int(long tensor)였기 때문에 이러한 에러가 난다. 따라서 input에 .float()를 붙여서 float type으로 바꿔주면 문제없이 실행이 된다.
내용의 출처는 인프런 - 조범희님의 확률과 통계 기초 강의입니다. 1. Hyper Geometric distribution : n개의 젤리를 랜덤하게, w/o replacement로 골랐을 때 Random Variable X = blue 젤리가 선택된 수 X ~ HyperGeometric(b, r, n) 예를 들어보자, n = 5, b = 2, r = 3 이라고 하자 이때 n = 5인 모든 발생 가능한 사건의 수는 b+rC5, b=2 r=3일때 발생 가능한 모든 사건의 수는 bC2 * rC3이다. 따라서 HyperGeometric(2, 3, 5) = bC2 * rC3 / b+rC5 이것을 일반화하면 b+r에서, n개를 w/o replacement로 선택할 때 {X = i} : i개의 blue, n-i개의..
내용의 출처는 인프런 - 조범희님의 확률과 통계 기초 강의입니다. 1. Geometric distribution (PX(x)) [X ~ Geometric(p)] : 불공평한 동전을 던진다. 이 때 앞면이 나올 확률 P(H) = p, 뒷면이 나올 확률을 P(T) = 1-p 라고 하자. 이때의 Random Variable X = 처음으로 앞면이 나올때까지 던진 coin tosses횟수이다. 즉 X = {1, 2, 3, ...}이다. X = 1 일때 PX(1) = p = (1-p)0p X = 2 일때 PX(2) = (1-p)p = (1-p)1p X = 3 일때 PX(3) = (1-p)(1-p)p = (1-p)2p X = n 일때 PX(n) = (1-p)(1-p)...(1-p)p = (1-p)n-1p 따라서 G..
모델 학습을 하다가 중간에 멈추는 경우 모델은 중단되었는데 전용 GPU 메모리는 할당된 채로 남아있는 경우가 있다. 자연스레 out of memory error가 발생하고 모델을 돌릴 수 없는데 torch.cuda.empty_cache() 함수를 사용해도 GPU 메모리가 지워지지 않는 경우가 종종 발생하더라. pip install numba를 입력해서 필요한 패키지를 설치해주고 다시 작성하던 노트북 파일이나 VS Code등으로 돌아와서 다음 코드를 입력하고 실행하자. !pip install numba from numba import cuda device = cuda.get_current_device(); device.reset() 아래와 같이 GPU 할당 메모리가 초기화 되는 것을 볼 수 있을 것이다. ..
Vector는 소문자 bold체로 나타냅니다(v) 소문자이면서 bold체가 아닌 경우(a)는 상수를 나타냅니다. 제곱이나 아래첨자를 업데이트 하지만 티스토리 블로그 특성상 작성이 불편하기 때문에 오타가 있을 수 있습니다. 구체적인 내용에 대한 전달이 아니라 기초적인 선형대수학의 정리를 모아놓는 포스팅입니다. 작성되는 포스팅은 모두 인프런 - 타블렛깍는노인 조범희님의 강의를 바탕으로 작성했습니다. 이전시리즈 2023.05.25 - [Background/Math] - 선형대수학 Linear Algebra 용어 및 기초 이론 정리/모음 2023.06.11 - [Background/Math] - 선형대수학 Orthogonality and Least Squares 정리/모음 (1) - Inner Product, ..
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